Braziliyada fanga noma'lum genlarga ega virus aniqlandi

Braziliyada fanga noma'lum genlarga ega virus aniqlandi
Braziliyada fanga noma'lum genlarga ega virus aniqlandi
Anonim

Olimlar Braziliyada DNKning 90 foizi fanga noma'lum bo'lgan yangi virusni topdilar. Kashfiyot natijalari bioRxiv preprint saytida e'lon qilinadi.

Virus Braziliyaning Belo -Orizonti shahridagi sun'iy Pampulha ko'lida aniqlangan. Uning unchalik murakkab bo'lmagan genomi deyarli butunlay fanga noma'lum bo'lgan genlardan iborat. Mualliflar yangi virusni Yaravirus brasiliensis deb Janubiy Amerika xalqlari mifologiyasidan olingan suv nymfasi nomi bilan atashgan.

Olimlar taxmin qilishicha, ular noma'lum izolyatsiya qilingan viruslar guruhi yoki gigant virusning uzoqroq turining kichik shakliga aylangan birinchi holatiga duch kelishmoqda.

Faqat 21 -asrda kashf etilgan gigant viruslar bakterial hujayralarnikiga o'xshash kattalikka etadi. Ular o'zlarining katta kapidlari - virionlarni qamrab oladigan oqsil membranalari - virus zarralari tufayli o'z nomlarini oldilar. Ular, shuningdek, mos keladigan uzunlikdagi DNKga ega, ular 200 ming asosiy juftdan oshadi va ko'pincha boshqa organizmlar guruhida topilmagan etim yoki etim genlarni (ORFan) o'z ichiga oladi.

Murakkab genomlar gigant viruslarga oqsillarni sintez qilish imkonini beradi va shuning uchun DNKni tiklash, replikatsiya, transkripsiya va tarjimani amalga oshiradi. Kashf qilinishidan oldin, viruslar bunday qobiliyatga ega emasligiga ishonishgan, chunki ular inert mavjudotlardir, ular faqat o'z uy egalarini yuqtirishi mumkin. Hamma ma'lum gigant viruslar amoebalarning parazitlari hisoblanadi.

Va yangi mikroorganizmlarning kattaligi gigant viruslarga qaraganda ancha kichik bo'lsa ham - taxminan 80 nanometr - u amoebalarda ham parazitlik qiladi va uning genomi deyarli etim bo'lib qoladi: uning 68 geni (90 foizdan ko'prog'i) o'z analogini topa olmaydi. ma'lum bo'lgan har qanday organizm va faqat oltitasi fanga ma'lum.

"Buning sababi shundaki, bu virus ajoyib kelib chiqishi va filogeniyasi bo'lgan amyob virusining yangi avlodidir", - deydi tadqiqot rahbarlaridan biri, Braziliyadagi Minas -Jerays federal universiteti professori Jnatas Avrao.

Olimlar sakkiz yarim mingdan ortiq metagenomlarni tahlil qilishdi, lekin ular orasida yangi mikroorganizmga tegishli viruslarni topmadilar. Bu guruhning boshqa viruslari singari, u 44900 tayanch juftlik va 74 ta kodlovchi bo'lakni o'z ichiga olgan ikkita zanjirli DNK bilan ifodalanadi.

"Standart protokollardan foydalangan holda, bizning birinchi genetik tahlilimiz yaravirusda hech qanday taniqli kapidlar ketma-ketligini yoki boshqa klassik virusli genlarni aniqlay olmadi",-tushuntiradi Yonatas Abrajao va Fransiyaning Aix-Marsel universitetining ikkinchi tadqiqot rahbari Bernard La Skola.

Rasmiy metagenomik protokollarga ko'ra, yaravirusni virusli agent sifatida ham tanib bo'lmaydi, chunki ular bilan aniq o'xshashlik yo'q. Olimlar hozircha uning kimligini ayta olmaydilar - bu mutlaqo yangi guruh vakili yoki qandaydir tarzda kichikroq shaklga aylangan ulkan virus avlodi.

"Yaravirus zarralarini tashkil etuvchi noma'lum oqsillar soni virusli dunyoda mavjud bo'lgan o'zgaruvchanlikni va qancha yangi virus genomlari hali ochilmaganligini aks ettiradi", deb xulosa qilishadi mualliflar.

Tavsiya: